Метод предполагает, что переданный параметр является полным URI, поэтому не кодирует зарезервированные значения, которые имеют специальные значения в URI.

Метод encodeURI заменяет все символы, исключая следующие, соответствующими им UTF-8 escape-последовательностями.

Тип
Включает в себя

Зарезервированные
; , / ? : @ & = + $

Незаменяемые символы
латинский алфавит, десятичные цифры, - _ . ! ~ * ' ( )

Значок решетки
#

Заметим, что encodeURI не может формировать данные для GET или POST-запросов, например, для XMLHttpRequest, так как "&", "+", и "=" не кодируются - а они являются специальными символами.

Их кодирует метод encodeURIComponent.